Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kcnma1Q08460 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcnma1Q08460 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcnma1Q08460 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms