Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms