Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Calb2Q08331 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms