Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnn1Q08091 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnn1Q08091 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms