Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nfe2Q07279 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms