Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox4Q06831 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox4Q06831 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox4Q06831 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox4Q06831 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox4Q06831 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox4Q06831 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox4Q06831 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox4Q06831 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox4Q06831 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox4Q06831 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox4Q06831 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox4Q06831 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox4Q06831 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox4Q06831 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox4Q06831 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox4Q06831 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sox4Q06831 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox4Q06831 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox4Q06831 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox4Q06831 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox4Q06831 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox4Q06831 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox4Q06831 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox4Q06831 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox4Q06831 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox4Q06831 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox4Q06831 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox4Q06831 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox4Q06831 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox4Q06831 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox4Q06831 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox4Q06831 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox4Q06831 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox4Q06831 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox4Q06831 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox4Q06831 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox4Q06831 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox4Q06831 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms