Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Prrx2Q06348 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms