Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SPINDOCQ05AH6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPINDOCQ05AH6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms