Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnal1Q05A62 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnal1Q05A62 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms