Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Thbs3Q05895 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs3Q05895 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms