Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Fmn1Q05860 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Fmn1Q05860 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fmn1Q05860 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms