Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelbQ04863 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelbQ04863 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RelbQ04863 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RelbQ04863 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RelbQ04863 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RelbQ04863 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelbQ04863 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelbQ04863 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RelbQ04863 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RelbQ04863 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RelbQ04863 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RelbQ04863 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms