Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Smarcad1Q04692 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms