Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mmp11Q02853 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mmp11Q02853 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mmp11Q02853 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mmp11Q02853 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mmp11Q02853 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp11Q02853 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp11Q02853 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp11Q02853 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp11Q02853 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp11Q02853 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp11Q02853 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp11Q02853 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp11Q02853 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp11Q02853 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp11Q02853 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp11Q02853 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mmp11Q02853 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mmp11Q02853 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mmp11Q02853 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mmp11Q02853 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mmp11Q02853 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms