Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb4Q02738 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gjb4Q02738 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms