Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RykQ01887 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RykQ01887 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RykQ01887 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RykQ01887 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RykQ01887 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RykQ01887 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RykQ01887 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RykQ01887 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RykQ01887 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RykQ01887 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RykQ01887 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RykQ01887 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RykQ01887 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RykQ01887 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RykQ01887 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RykQ01887 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RykQ01887 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RykQ01887 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RykQ01887 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RykQ01887 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RykQ01887 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RykQ01887 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RykQ01887 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RykQ01887 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RykQ01887 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RykQ01887 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RykQ01887 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RykQ01887 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RykQ01887 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RykQ01887 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RykQ01887 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RykQ01887 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RykQ01887 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RykQ01887 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RykQ01887 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RykQ01887 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RykQ01887 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RykQ01887 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RykQ01887 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RykQ01887 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RykQ01887 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RykQ01887 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RykQ01887 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RykQ01887 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RykQ01887 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RykQ01887 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RykQ01887 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RykQ01887 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RykQ01887 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RykQ01887 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RykQ01887 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RykQ01887 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RykQ01887 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RykQ01887 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RykQ01887 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RykQ01887 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RykQ01887 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RykQ01887 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RykQ01887 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RykQ01887 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RykQ01887 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RykQ01887 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RykQ01887 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RykQ01887 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RykQ01887 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RykQ01887 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RykQ01887 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RykQ01887 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RykQ01887 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RykQ01887 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RykQ01887 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RykQ01887 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RykQ01887 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RykQ01887 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RykQ01887 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RykQ01887 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RykQ01887 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RykQ01887 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RykQ01887 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RykQ01887 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RykQ01887 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RykQ01887 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RykQ01887 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RykQ01887 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RykQ01887 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RykQ01887 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RykQ01887 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RykQ01887 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RykQ01887 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RykQ01887 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RykQ01887 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RykQ01887 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RykQ01887 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RykQ01887 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RykQ01887 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RykQ01887 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RykQ01887 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RykQ01887 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RykQ01887 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms