Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VcpQ01853 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VcpQ01853 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VcpQ01853 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VcpQ01853 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VcpQ01853 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VcpQ01853 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VcpQ01853 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VcpQ01853 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VcpQ01853 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
VcpQ01853 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms