Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nme2Q01768 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms