Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec23aQ01405 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sec23aQ01405 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec23aQ01405 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms