Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EgfrQ01279 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EgfrQ01279 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms