Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde1bQ01065 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms