Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb2Q00977 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gjb2Q00977 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms