Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VegfaQ00731 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
VegfaQ00731 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms