Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeleQ00690 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SeleQ00690 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SeleQ00690 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SeleQ00690 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SeleQ00690 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SeleQ00690 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SeleQ00690 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeleQ00690 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms