Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga4Q00651 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Itga4Q00651 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga4Q00651 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms