Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
F8a1Q00558 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
F8a1Q00558 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F8a1Q00558 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F8a1Q00558 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F8a1Q00558 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F8a1Q00558 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
F8a1Q00558 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F8a1Q00558 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F8a1Q00558 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
F8a1Q00558 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
F8a1Q00558 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
F8a1Q00558 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms