Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabpb1Q00420 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabpb1Q00420 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms