Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shc1P98083 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shc1P98083 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shc1P98083 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc1P98083 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shc1P98083 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shc1P98083 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Shc1P98083 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shc1P98083 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms