Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lama4P97927 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lama4P97927 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lama4P97927 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lama4P97927 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lama4P97927 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lama4P97927 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lama4P97927 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lama4P97927 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lama4P97927 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lama4P97927 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lama4P97927 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lama4P97927 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lama4P97927 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lama4P97927 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lama4P97927 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lama4P97927 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lama4P97927 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lama4P97927 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lama4P97927 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lama4P97927 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lama4P97927 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lama4P97927 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lama4P97927 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Lama4P97927 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lama4P97927 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms