Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AlkP97793 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AlkP97793 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
AlkP97793 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AlkP97793 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AlkP97793 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AlkP97793 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
AlkP97793 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AlkP97793 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AlkP97793 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AlkP97793 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AlkP97793 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AlkP97793 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AlkP97793 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AlkP97793 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AlkP97793 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AlkP97793 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AlkP97793 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AlkP97793 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AlkP97793 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AlkP97793 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AlkP97793 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AlkP97793 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AlkP97793 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AlkP97793 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AlkP97793 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
AlkP97793 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AlkP97793 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AlkP97793 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AlkP97793 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AlkP97793 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AlkP97793 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AlkP97793 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
AlkP97793 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
AlkP97793 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AlkP97793 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AlkP97793 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AlkP97793 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AlkP97793 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
AlkP97793 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AlkP97793 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AlkP97793 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AlkP97793 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AlkP97793 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AlkP97793 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AlkP97793 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AlkP97793 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AlkP97793 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
AlkP97793 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AlkP97793 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
AlkP97793 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AlkP97793 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AlkP97793 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AlkP97793 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AlkP97793 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AlkP97793 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AlkP97793 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AlkP97793 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AlkP97793 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AlkP97793 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AlkP97793 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AlkP97793 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
AlkP97793 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AlkP97793 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AlkP97793 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AlkP97793 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AlkP97793 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AlkP97793 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AlkP97793 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AlkP97793 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AlkP97793 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AlkP97793 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
AlkP97793 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
AlkP97793 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
AlkP97793 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
AlkP97793 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AlkP97793 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AlkP97793 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AlkP97793 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AlkP97793 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
AlkP97793 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AlkP97793 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AlkP97793 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AlkP97793 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AlkP97793 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AlkP97793 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AlkP97793 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AlkP97793 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
AlkP97793 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AlkP97793 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AlkP97793 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AlkP97793 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AlkP97793 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AlkP97793 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AlkP97793 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AlkP97793 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AlkP97793 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AlkP97793 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AlkP97793 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AlkP97793 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms