Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smyd1P97443 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smyd1P97443 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms