Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhodP97348 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhodP97348 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhodP97348 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhodP97348 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RhodP97348 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhodP97348 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhodP97348 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhodP97348 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhodP97348 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhodP97348 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhodP97348 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RhodP97348 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhodP97348 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhodP97348 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhodP97348 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RhodP97348 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhodP97348 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhodP97348 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhodP97348 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhodP97348 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhodP97348 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhodP97348 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhodP97348 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhodP97348 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhodP97348 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RhodP97348 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhodP97348 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhodP97348 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhodP97348 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RhodP97348 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhodP97348 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhodP97348 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhodP97348 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhodP97348 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhodP97348 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhodP97348 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhodP97348 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhodP97348 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhodP97348 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhodP97348 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhodP97348 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhodP97348 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhodP97348 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhodP97348 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RhodP97348 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhodP97348 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhodP97348 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhodP97348 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhodP97348 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RhodP97348 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhodP97348 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhodP97348 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhodP97348 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RhodP97348 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RhodP97348 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RhodP97348 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhodP97348 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhodP97348 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhodP97348 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhodP97348 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhodP97348 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhodP97348 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhodP97348 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhodP97348 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RhodP97348 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhodP97348 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhodP97348 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhodP97348 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhodP97348 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhodP97348 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhodP97348 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhodP97348 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhodP97348 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhodP97348 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhodP97348 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RhodP97348 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhodP97348 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhodP97348 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhodP97348 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhodP97348 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhodP97348 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhodP97348 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhodP97348 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhodP97348 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhodP97348 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhodP97348 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhodP97348 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhodP97348 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhodP97348 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhodP97348 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhodP97348 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhodP97348 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhodP97348 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhodP97348 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhodP97348 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhodP97348 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhodP97348 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhodP97348 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RhodP97348 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms