Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkdcP97313 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkdcP97313 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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