Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx1P81068 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx1P81068 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Irx1P81068 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx1P81068 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx1P81068 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx1P81068 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx1P81068 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx1P81068 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx1P81068 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx1P81068 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms