Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8a1P70704 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8a1P70704 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8a1P70704 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8a1P70704 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8a1P70704 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8a1P70704 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8a1P70704 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8a1P70704 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8a1P70704 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8a1P70704 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms