Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad50P70388 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad50P70388 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad50P70388 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad50P70388 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad50P70388 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad50P70388 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad50P70388 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad50P70388 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms