Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aup1P70295 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aup1P70295 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aup1P70295 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aup1P70295 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Aup1P70295 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Aup1P70295 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aup1P70295 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms