Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sycp3P70281 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sycp3P70281 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms