Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf6P70279 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf6P70279 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf6P70279 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf6P70279 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Surf6P70279 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Surf6P70279 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf6P70279 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Surf6P70279 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms