Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdlim4P70271 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdlim4P70271 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms