Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rad54lP70270 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rad54lP70270 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rad54lP70270 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms