Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf5P70191 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf5P70191 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf5P70191 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf5P70191 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf5P70191 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf5P70191 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Traf5P70191 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf5P70191 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf5P70191 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf5P70191 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf5P70191 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms