Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SnrpnP63163 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SnrpnP63163 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SnrpnP63163 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms