Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Barhl1P63157 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Barhl1P63157 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Barhl1P63157 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Barhl1P63157 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Barhl1P63157 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Barhl1P63157 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Barhl1P63157 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Barhl1P63157 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Barhl1P63157 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Barhl1P63157 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Barhl1P63157 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms