Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtnP63089 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtnP63089 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtnP63089 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtnP63089 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtnP63089 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtnP63089 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtnP63089 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtnP63089 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtnP63089 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtnP63089 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtnP63089 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtnP63089 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtnP63089 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtnP63089 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtnP63089 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtnP63089 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtnP63089 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtnP63089 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtnP63089 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtnP63089 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtnP63089 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtnP63089 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtnP63089 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtnP63089 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtnP63089 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtnP63089 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtnP63089 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtnP63089 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PtnP63089 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtnP63089 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtnP63089 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtnP63089 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtnP63089 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtnP63089 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtnP63089 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtnP63089 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtnP63089 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtnP63089 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtnP63089 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtnP63089 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtnP63089 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtnP63089 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtnP63089 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtnP63089 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtnP63089 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtnP63089 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtnP63089 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtnP63089 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtnP63089 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtnP63089 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtnP63089 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PtnP63089 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtnP63089 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtnP63089 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtnP63089 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtnP63089 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtnP63089 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtnP63089 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtnP63089 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtnP63089 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtnP63089 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtnP63089 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtnP63089 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtnP63089 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtnP63089 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtnP63089 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtnP63089 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtnP63089 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtnP63089 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtnP63089 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtnP63089 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtnP63089 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtnP63089 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtnP63089 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtnP63089 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtnP63089 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtnP63089 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtnP63089 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtnP63089 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtnP63089 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtnP63089 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtnP63089 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtnP63089 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtnP63089 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtnP63089 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtnP63089 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtnP63089 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtnP63089 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtnP63089 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtnP63089 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtnP63089 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtnP63089 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtnP63089 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtnP63089 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtnP63089 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtnP63089 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtnP63089 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtnP63089 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PtnP63089 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms