Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps3P62908 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps3P62908 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps3P62908 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps3P62908 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps3P62908 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps3P62908 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps3P62908 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps3P62908 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps3P62908 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps3P62908 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms