Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arf6P62331 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arf6P62331 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arf6P62331 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf6P62331 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf6P62331 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf6P62331 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf6P62331 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf6P62331 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf6P62331 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf6P62331 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf6P62331 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf6P62331 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf6P62331 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arf6P62331 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arf6P62331 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arf6P62331 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arf6P62331 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arf6P62331 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arf6P62331 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arf6P62331 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arf6P62331 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arf6P62331 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf6P62331 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf6P62331 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf6P62331 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arf6P62331 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms