Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snrpd2P62317 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd2P62317 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd2P62317 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd2P62317 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd2P62317 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd2P62317 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd2P62317 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd2P62317 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd2P62317 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snrpd2P62317 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms