Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp46P62069 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp46P62069 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp46P62069 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp46P62069 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp46P62069 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp46P62069 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp46P62069 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp46P62069 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp46P62069 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp46P62069 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp46P62069 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp46P62069 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp46P62069 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp46P62069 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp46P62069 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp46P62069 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp46P62069 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp46P62069 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp46P62069 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp46P62069 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp46P62069 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp46P62069 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp46P62069 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp46P62069 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp46P62069 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp46P62069 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp46P62069 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp46P62069 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp46P62069 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp46P62069 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp46P62069 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp46P62069 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp46P62069 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp46P62069 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp46P62069 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp46P62069 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp46P62069 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp46P62069 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms