Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnd3P61588 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms